پایگاه اطلاع رسانی ریسمان ـ سهشنبه ۲۱ بهمنماه ۹۹؛ حسین جندقیان، پس از حضور در واحد احکام دادسرای اوین بازداشت و جهت تحمل حبس به زندان اوین منتقل شد. وی پیشتر توسط دادگاه انقلاب تهران به یک سال حبس تعزیری محکوم شده بود. این حکم در مرحله تجدیدنظر به شش ماه حبس کاهش پیدا کرد.
حسین جندقیان در تاریخ ۲۳ شهریورماه ۹۴ توسط ماموران اطلاعات سپاه بازداشت و به بازداشتگاه این نهاد موسوم به بند ۲ الف زندان منتقل گردید. حسین جندقیان پس از ۲۲ روز با تودیع قرار وثیقه ۱۰۰ میلیون تومانی به صورت موقت و تا پایان مراحل دادرسی آزاد شده بود.
وی در تاریخ ۲۶ فروردین ماه ۹۶ توسط شعبه ۲۸ دادگاه انقلاب تهران به ریاست قاضی محمد مقیسه به اتهام «فعالیت تبلیغی علیه نظام» به یک سال حبس تعزیری محکوم گردید.
این حکم در مرحله تجدیدنظر توسط شعبه ۵۴ دادگاه تجدید نظر استان تهران به ریاست قاضی بابایی و مستشاری قاضی زنجانی به شش ماه حبس تعزیری تقلیل یافت.